扶桑的“都察院”是以大目付为首的各种目付组成，其中大目付直属老中，目付直属若年寄，大目付负责对皇室的小朝廷、诸侯、高家和大身旗本进行监督和举报，下一级的目付负责监督普通旗本和各级御家人，属下专治巡视和刺探的是巡见使、隐者等。
中华三院六部的六部是吏、兵、礼、户、刑、工，幕府对应的机构如下：
吏部这么高上大的东西不适合扶桑，幕府用人全靠提名，做到了内举不避亲，役职候选人靠内外共举，够资格的都可以提名，高层役职和重要职位拍板靠将军和老中，中下级职位靠上层拍脑袋。
至于外举不避仇，反正肉烂在锅里，大家相爱相杀两百多年，谁还没有两个死对头。
扶桑的兵部比较复杂，因为分封制，幕府有自己的部队，诸侯有自己的部队，幕府的旗本也有自己的私人部队，只有御家人哭晕在厕所。
幕府的直属部队分为大番头组、新番头组、御小姓组、御书院组、留守居组和各地代官的直属部队，以上都是常备军，上下都是幕府的旗本和御家人。
幕府大番共十二组，驻扎在江户，受老中和若年寄直接指挥，每组包含番头一名、组头四名、番士五十名、与力十名、同心二十名，加上足轻每组总兵力约四百，十二组大番总兵力约五千人——直秀街坊邻居的祖上都是大番组成员。
新番头组是将军的出行护卫；御小姓组顾名思义是将军的亲兵“小姓”——小栗忠顺赫然在列；御书院组负责守护将军人身安全，类似中华的大内高手；留守居组负责江户城的警备，类似中华的皇城警卫。
各地的御领，也有部队。
除了常备军，后备军是全体幕府武士，既然被称作武士，那如果幕府有事，所有的旗本和御家人都有责任上阵。
因为没有科举，而且皇室的小朝廷也举行祭祀活动，因此幕府的礼部就萎缩成高家、奏者番、诘众和官学。高家是一种特殊的旗本等级，多是失地的有名大名后代，奏者番和诘众是大名，一般作诘众的大名其领地石高相对较低。
幕府官学是昌平簧，也称昌平板学问所，除江户本校外，还在御领各地设有分校，如长崎的明伦堂、甲府的征典馆、骏府的明新馆、佐渡的修教馆、日光的学问所等，本校、分校都以儒学教育为主，由本校派遣教师授课，五代将军纲吉命林罗山的三代孙林凤冈为昌平簧的大学头，之后由林家世袭主持这所学校。
有趣的是，幕府官学昌平簧不但对各大名的
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