该组织的活动相当活跃，在木叶发挥着独特作用。
但由于三代火影无法容忍志村团藏将人培养成杀人机器的行为，在宇智波灭族事件之后，下令解除团藏“火影辅佐”的职务，并下令“根”解散。
虽然“根”在宇智波灭族事件后就已经解散，但仍有不少前成员继续在暗部任职，甚至效忠于“根”。
所谓“根”之人没有名字，亦无感情，没有过去，亦无未来，心中只有任务，在背后支撑起木叶村这棵大树的是，深扎于大地之中，我等“根”的意志。
在根部里面，每天都会有忍者外出执行任务，有的是暗杀任务，有的是潜入别的忍者村，刺探敌情。
当他们发现其他忍者村的密探后，通通都会带到这里，进行最严酷最残忍的拷问。
这片区域内到处都充斥着阴冷的气息，整个拷问室中弥漫着浓郁的血腥味，简直让人作呕。
而慕清霄的对面，正坐着一名戴着银色面具的精英上忍。
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