为祸之烈尤胜官府，失去了最开始起义的目的，逐渐引发了各地民众的反抗情绪。
终于，就在同年的5月，皇甫嵩设计在长社火烧黄巾军，大败黄巾主力部队，拉开了黄巾军败亡的序幕，短短一个月的时间，各地如火如荼的起义大军接连遭受了沉痛的打击。
同年8月份，张角于广宗病死，黄巾军一下子群龙无首，很多对张角死忠的教徒因为没有了领袖而变得没有战心。朝廷军队抓住战机，反击黄巾军，将黄巾军杀得节节败退。最终于184年11月，皇甫嵩与巨鹿太守郭典攻下曲阳，成功地斩杀张宝，俘虏多达十余万人，至此，黄巾之乱终于平息。
黄巾之乱虽然只进行了短短的九个月时间，但是它为东汉朝廷带来的影响却是深远的，一方面残留下了不少叛军分散在各地，使得许多地区甚至成为了政府无力管辖的三不管地带；另一方面，也同时暴露出东汉朝廷积重难返的弊端，各地的军阀野心家们也都逐渐的开始蠢蠢欲动。
尤其是在此后不久，188年刘焉上书朝廷，为了镇压各地的黄巾余党，建议天子恢复州牧制度，派遣大批廉洁忠诚的大臣坐镇一方担任州牧，这一建议更是加剧了东汉末年群雄割据的形成。当然这都是后话。
并州因为地处边疆，且这里民众们最大的敌人不是朝廷的压迫，而是塞外游牧民族的侵略，因此张角并没有将此地作为一个发展重心，再加上丁原这几年大力发展民生，吕布在之前也做了不少的准备工作，因此并州没有受到黄巾起义的影响。
早在从草原远征归来的时候，吕布就做了几件大事。
第一件，他利用身份的便利，在并州各地开办酒店客栈，名为赚钱，实为设立情报据点。来自于后世的吕布可是深深的明白情报的重要性，尤其是在现在这种传递情报手段单一并且效率低下的冷兵器时代，拥有比对手更快更准确的情报来源经常可以决定一件事情甚至是一场战争的成败。
而这件事情吕布也并没有隐瞒丁原，原本就将吕布视为接班人的丁原听到此事后更是大力支持。
第二件事就是在朝廷下发旨意，各地整理武备准备剿灭黄巾叛乱时建议丁原扩充武备，建立更加强大的骑兵部队，最终也在丁原的首肯之下，将并州的骑兵部队扩展到三万人的规模，而其他部队规模不变，这也是并州的财力所能支撑的极限了。
第三件事，上一次草原远征时，远征部队配备马蹄铁和双边马镫，在战斗中获得了巨大的优势。尝到了甜头的吕布开始大力发展匠
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