保管和发放，车驾清吏司掌管军马的牧养和分配；户部掌管军费及发放粮饷；工部掌军需制造，凡甲具、武器、火药、战车、战船修造等，都属其责。
每年的军需预算，是由兵部提出预案，然后会同工部、户部进行磋商，最后定下方案，在内阁年终财务会议上提出，通过后，该拨款拨款、该生产生产，然后再由兵部验收后，下发到各军队。整个流程中，兵部即负责提出标准，又负责最后把关，所以其占据着主导的地位。
但如果这种中央统筹分配，能够被有效地贯彻执行，也可以满足这个庞大帝国的军事需要，然而更糟糕的情况是，各部并没有直接控制生产的能力，生产执行全赖互不相属的下级机构……以盔甲的生产为例，在燕郊设有工部下属的兵甲厂一处，这是为京营官兵提供五万套甲具的法定兵工厂。然而事实上，这个兵甲厂本身每年只能制造五千套甲具，其余的九成订单，是分包给散落在燕京、天津、保定、甚至山东的近百家小型作坊，共同生产、拼合凑拢而成。各厂之间各自经理。虽有一个类似于总管理处的工部兵器局居中协调，然而它却无统一调度人力和物资的权能，自然也更谈不上有效的技术分工。
不消多说，组织上的低能和混乱必然造成装备上的落后，更是[***]滋生的温床。大明的工艺水平其实很高，也不缺乏这方面的能工巧匠，这从禁军四卫和军官们的精良装备上便可见一斑。然而其余的部队，只能装备衬以小铁片的棉布祆，或者由纸筋搪塞而成的‘纸甲’，少量金属甲具，也是质量差、规格乱，根本谈不上精良，十分的寒碜。
其余的武器装备也是如此，然而，朝廷的采购款可没少拨付，都是按照标准装备定价，每年数以百万计的银两花出去，就换回这一堆假冒伪劣。部队装备上，能有战斗力，那才叫见了鬼。
内阁虽然愤怒，然而这池子水太深了，里面涉及的方方面面，有王公贵族，有皇亲国戚，有各部官员，甚至有大学士们本身也收受过这方面的孝敬，让他们如何有彻底查办的决心？
当然，现在‘内阁’的同义词，完全可以换成‘徐阶’，高拱走了，内阁已经彻底变成徐阁老的一言堂，其余一干大学士，全成了奉命行事的甲乙丙丁。在朝野中，他更是一呼百应，其权势甚至超过了皇帝，可谓如曰中天，唯我独尊！
从本心讲，徐阶是希望能好好整顿一下军事，振作大明的边防，像严嵩消除东南沿海的倭患那样，也把北方的鞑虏解决掉，然而与南方的乌合之众般的海盗相比，北方的鞑
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