这两个东西都会是超大号的，平时背在身后，战斗时会拿在手上。
毛笔的大小会比匕首还要略长一些，跟短剑差不多，画卷则是会跟盾牌的长度类似，而且画卷在防御时会展开。
2D的主角变成了3D，各种操作及游戏中的内容自然也要有所变化。
《水墨云烟2》的故事中，书生依旧是用书法和绘画作为主要的战斗方式。
玩家可以进行的基础操作包括：移动（行走、奔跑和冲刺），跳跃（包括二段跳跃、滑翔），攀爬（常规攀爬和强行攀爬），防御，基础攻击（普通近战、普通远程）。
这其中有一些比较常规的设定，比如移动，轻推摇杆是慢走，摇杆推的幅度越大跑动速度越快，点击摇杆是蹲伏潜行。跳跃、攀爬这些，也基本上跟《生肖守护者》等常规的游戏类似。
除此之外，很多特殊的操作根据游戏的世界观和书生的技能进行了全新的包装。比如，按下冲刺键之后书生可以快速冲刺，在下坡的时候书生可以滑行，空中可以二段跳跃，一些光滑的地方可以强行攀爬。在用出这些操作的时候，书生的手上、脚上会出现黑色的墨迹，表示他正在使用特殊的技能。
比如滑行，当书生从高坡向下滑的时候，他的脚下会出现一道黑色的墨迹波浪，与此同时，他的“墨量”会快速消耗。
同理，在强行攀爬的时候，书生的手上会出现墨迹；二段跳跃的时候，脚下会出现一个墨迹构成的平台；滑翔的时候，书生的双手会抓着一个水墨风的风筝，慢慢地往下飘。
这些操作都需要消耗“墨量”，这个值可以看成是常规的“精力值”，但实际上它代表着书生存储在砚台内墨的数量，他可以通过这些墨来完成各种酷炫的操作。
此外，书生的基础攻击和基础防御也跟笔墨有关。
他的基础防御是抬起左手的画卷在面前构筑一个虚幻的山峰，可以当做盾牌使用，抵御敌人的攻击。画卷的防御技能是需要充能的，每次受击都会减少充能。
基础攻击分为两种，近战攻击是书生挥动手中的笔模拟长枪、刀剑、长兵器造成近战伤害，远程攻击则是书生挥舞手中的笔甩出墨汁攻击远方的敌人。
近战攻击分为很多不同的攻击方式，刀剑可以跟盾牌一同使用，长兵器则必须双手握住毛笔。而不同的近战攻击也都是需要充能的，每次攻击都会减少充能。
远程攻击同样分为不同的攻击属性，出普通攻击外，还有木、金、火、水、土五
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