朱燮元的奏疏中建议保留安位的土司地位不变，为了增加说服力还举了很多这样做的优点，比如说保留土司制度是尊重当地人的风俗，让他们自己人管自己人可以省很多麻烦，同时朝廷也不用花费钱粮來扶贫等等。最后说最大的好处是给其他土司一个榜样，让他们知道造反沒有前途，当良民就可以继续关起门作威作福沒人会管你。其中心思想还是当年诸葛亮的想法，就是当地人管当地事打造一个稳定的后方。
诸葛亮的想法在当时是正确的，但是时间已经过去了上千年，以前的用力方向是中原，西南方向是后方需要尽快经营好，现在的用力方向是向西南扩张，再抱着老观念做事就是南辕北辙就会出问題。天启已经明确提出西南地区今后的任务是逐步调整土司，调整的原则就是土司只能管一定的军队不能既管军又管民。天启的意思就是让所有土司的手下都只有军队而沒有民众跟随，如此一來他们沒有了根基都离不开朝廷想作乱也作不了。
朱燮元知道自己犯了方向性的错误，于是立即说道：“皇上的旨意我们必须无条件服从，只是具体该怎么做一时还搞不清楚，两位钦差能不能详解一下？”
刘侨说：“我们跟朱大人一样都是刚刚得到旨意，怎么办还是朱大人自己拿主意要好些。”
杨涟说：“我是文官对军事不懂，但这几天我看见贵阳周边一带做得很好，尤其是军队先开进百姓随后跟从的法子不错，稳扎稳打快速安民不给叛匪留空隙，朱大人可以按原來的办法继续做就可以。”
朱燮元听了后转头对大家说道：“既然如此我先暂时安排一下，如果诸位有疑问可以当着钦差的面提出來商议，如果商议不出结果我们立即请旨便是。一直以來安位就不想跟官军过不去，曾经还私下找我们议和过，现在首恶奢崇明和安邦彦死了，我认为现在安位也想跟我们议和，只是不知道我们现在要拿他怎么办。安位现在调兵遣将固守织金、大方一带，只是为了展示一个强硬的态度，其目的是想在谈判中多捞点好处，我的看法不知道诸位以为如何？”
川、黔诸将原來的不和是为了争功，既然皇帝要求自己写经过其他人证明最后朝廷专门机构认定，大家的关系才缓和了下來，现在见朱燮元相问都说朱大人所见极是。
朱燮元知道这些人也说不出什么，于是接着说道：“既然皇上将军队分为野战部队和守备部队，给秦良玉秦总兵的一年之期也将满，就由秦总兵打头开始对付安位。其他守备部队的人马慢慢跟进固守要害处，如果沒有出乱子
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