卫指挥使，正三品。之后是卫指挥同知从三品。再后是卫指挥佥事正四品。每一个卫的标准编制是5600人。至于都督、将军、总兵只是出现战事的时候所临时任命的，有时也有荣誉头衔的性质。
御营五军经过整编，被扩大为350000人。已经重新被分为七个镇，每个镇的总兵官均由一个指挥使担任，七个指挥使分别为陈友龙、王允才、王进才、蒋建勋、傅山、焦琏、白贵。其中陈友龙、王允才、王进才、傅山、焦琏都算是平级调动，蒋建勋作为高必正的副将、白贵作为焦琏的副将屡有战功因此升任。其中蒋建勋还被晋封蒋山伯，是所有西北义军将领中第一个因功封爵的人。
朱四还从新划分了校练卫的指挥权，直接由皇帝亲自统领，人数增加到15000人，待遇全军最高，装备自理。御营石柱军人数扩大至30000人，晋封指挥使秦拱明为破虏将军。取消北军步营编制，所部全部编入御营骑兵，御营骑兵扩编至300000万，原来的御营骑兵以及御营北军步营和骑营全部合并到这里。在十万北军校练营和十八万西北团练中选出二十万骑兵，在江南团练中选出四万骑兵加以训练，合计原有南北御营骑兵共计300000人。
只是战马暂时达不到如此规模，储备战马供给了三千营数万匹后还有二十万匹，加上原有御营南北军的战马要想供给三十万的御营骑兵，尚有四万匹的缺口。不过先成军再说，战马还是可以购买的，尤其是当清军中原大败之后，蒙古各部更是愿意向大明靠拢，所以能够购买的战马数目会比之前增加不少。三十万御营骑兵被分为了六个军，每两军有都督一名。三位都督分别是马万年、高必正、洪承畴。
这三人也是这次大战中功劳最大的。马万年的御营骑兵在归德的夏邑和虞城已经开封城外的三次大战都有战功，洪承畴更是做了两次先锋，与堵胤锡迎击整个清军主力。而高必正兵力弱小却战至最后，为两支明军主力先后集结到虞城，实现预定战略目的起到了关键作用，再综合高必正此前光复南京的功劳与其他二人同升为御营骑兵都督一职。
六个骑兵军任命了六个指挥佥事分别为王永镇、丁国栋、米喇印、刘迁、张五桂、郑名标。堵胤锡阵亡后，被追封为豫北王、金紫光禄大夫，秦翼明改任兵部尚书，王船山改任工部尚书，顾亭林升任礼部尚书。还有山东的李元胤、郑鸿逵、郑成功因战事尚未完结，先予赏金若干。司礼监掌印太监庞天寿因节制西洋拥军有功，授予国姓，这庞天寿以后就应该叫朱天寿了，不过和寇湄、
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