在内阁议定之后，便开始下令执行，明军俘虏的近四万蒙古人，还有投降的六万蒙古人，被明朝编成了二十个卫，分布于漠南和科尔沁草原。
不过因为只剩下十万多人，实力远远弱于漠北蒙古，为了避免被漠北诸多部落兼并，所以这些个卫所只能在靠近长城和宁辽一带分布，并不能控制整个漠南和东蒙古草原，许多原来的牧场，都成为了无人地带。
明朝收获的百万头牛羊，有四十万只绵羊被兵部留下，二十万只羊和一万头牛拿到民间出售，另外的则交给各蒙古卫所放养。
兵部的四十万头，只拿走十万头分配各镇，另外三十多万头，也交给了蒙古各卫放养，但此后三年内，各卫所需要每年向兵部输送十万头牛羊，三年后兵部按着市价，每年够买十万只牛羊供军队消耗，只是羊肉其实并不适合给士卒吃，不过兵部今后会鼓励各卫多养肉牛。
这个办法如果实行的好，不仅明军的战马不用愁，骑兵能加强，士卒在体质上也会有所提升。
在对各部落和俘虏进行整编时，蒙古部落中的几个台吉还有比较重要的贵族，都被送到南京，赐予宅子和田产恩养，被选为卫所千户的蒙古人，则须送一子到南京学习汉字、汉话还有军事，即是当做人质，也是对他们进行培养。
毕竟归附大明的蒙古人只是少数，在草原上属于弱势的一方，加上被分成若干卫所，力量就更加分散，很容易被其他大的部落盯上，所以需要提高他们的能力自保。
不然明朝花功夫培养之后，被其他未臣服的部落吞并，没有起到为大明屏障的作用，那就白费功夫了。
在编成卫所，划分牧场之后，朝廷便下令所有归附的蒙古人都赐归义的身份，然后视表现再赐予明籍。
这时按着命令，福临的首级，首先就是在这些蒙古卫所中传递一遍，并就努尔哈赤本为家奴，却叛乱弑主的不耻行径，进行宣传，以警醒蒙古各卫。
在蒙古传递之后，首级传到了正在筑锦州城的满族俘虏手中，让他们绝了反抗之心，老实赎罪，今后像归义伯谭泰一样，挣个好身份，从新做人。
这些每日没夜劳作的俘虏，其实对于大清曾经的辉煌，多少还存在一丝幻想，可是当他们看到福临等人的首级之时，便彻底绝望了。
大明在国破家亡之时，有忠贞之士，泣血痛苦，其他的民族其实也有，不少满人看见他们皇帝的头颅，便有人忍不住痛哭起来，甚至有人为此自杀，但绝大多数人在神伤之后，很快就恢复
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