野（主要是东林党）铺天盖地的弹劾臭骂，最终灰溜溜的下台，荣幸的成为由争国本所引发的党争中第一批翻船的人。
万历二十一年，浙党上台坐庄，王锡爵继任首辅。他吸取前任宣党的教训，顶住压力和皇帝进行不屈不挠的斗争。万历迫于廷臣压力，玩了招避实就虚曲线救国，封常洛为王以示恩宠，但是同时也封皇三子常洵和另一个皇子常浩一并为王，这就是有名的三王并封。
此事表面上看不分高下，无有偏颇，而其真实意图却昭然若揭，是想将立储事再度搁置，以拖促变。当时皇后无子，万历打的主意是持久战，把皇后拖死，然后扶正郑妃。这样常洵将成为皇嫡子，立为太子将不在有任何障碍。
王锡爵没能领会其中玄机，又觉得皇帝做出让步已经不易，可以视为士大夫们的胜利，竟然同意。结果下场可想而知，遭到东林党人的更加猛烈的群起痛骂，王锡爵几乎官位不保。次年，万历最终同意皇长子出阁讲学，此时朱常洛已经十三岁了。
在其后的几年里，廷臣们就立太子事进行了不知疲倦的争论。在前赴后继不计后果的和皇帝对抗中被贬落马的官员不计其数，而明代东林党的开山祖师顾宪成就是其中之一。
万历二十二年，顾宪成被贬回乡。十年后，他和弟弟在无锡组织了东林书院，开始政治讲学，逐渐形成了一个江南士大夫、朝中廷臣、地方实力派结合在一起的政治集团。这便是后来历史上大名鼎鼎的东林党。
廷臣中在十几年争国本中表现活跃，骂声最大的一批人后来都成为了东林党的成员。他们积极的表现自己，猛烈攻击执政的其他党派内阁在位时对于国本原则问题软弱无能的表现。这固然提高了他们的形象，但是也彻底得罪了其他的诸如宣、浙、齐、楚、昆等诸党，为万历后期党争大混战埋下了祸根。
万历二十九年，前后经过两次“妖书案”的闹剧搅和、饱受了无数明枪暗箭的痛击，郑贵妃已经成为满朝同骂之、天下共讨之的声名狼藉的女人。再加上太后的压力、一批又一批廷臣的车**战，身心俱疲的万历终于顶不住了，宣布册封朱常洛为太子，朱常洵为福王，争国本事件至此终于暂时告一段落。
但是此时朝中已经形成了以东林党和秦党为一方，宣、浙、齐、楚、昆等诸党联盟为一方的两大对立阵营，双方失去了共同的目标之后，争国本期间所积下来各种恩怨开始集中清算，双方通过京察反复较量长达十余年。
去年，也就是万历四十五年，经过漫长的斗争，东
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