至于正一品正二品的等级，乃是散官阶级，即寄禄官（发工资的等级），颜常武正式设置文武官员分等，其中文官分为1等文官到29等文官，数字越小官越大。
还是复古，这回用上了唐代的散官制度进行参照，即唐朝散官从从一品的开府仪同三司开始直到从九品下的将仕郎，共有29等级，其中从一品的开府仪同三司即1等文官，将仕郎为29等文官……
再有文官官制（实职），初步设立为军机处乃是处理军政事务的中枢，军机处设置有首席执行官、首席运营官、首席财务官、首席人事官、首席参谋长；分别为陈衷纪、洪升、陈和彬、陈衷纪和甘辉。
军机处的职责权势一如明朝的内阁，协助督军处理东南府的军政事务，有票拟的权利，但无副署权。
在收到各部、各地的行政文书后，军机处进行初步处理，其建议写在一张纸上，贴在行政文书的上面，这叫做票拟。
之后督军用红字做批示，叫做批红。
因此军机处负责督军下达的命令及参预官员上报文书的处理，还有督军交议的大政，可进行重大案件的审理，官员的任免，财政支出，还有军务参预之权。
由于东南府督军长期在外，因此军机处代办军政事务，等督军回来，一一确认，所以军机处权柄重大。
但是，督军所下达的命令（不能说是旨意，因为没造反），哪怕与军机处相左（不同），亦可推行，亦即军机处无副署权。
副署权，如唐宋朝，皇帝与宰相共治天下，皇帝旨意如无宰相副署，则无实效，朝臣可以不认这个旨意，此乃皇帝自我约束，遂行兼听则明，但颜常武不会给自己找不自在，即臣下有不同意见，可以“保留意见”，但必须执行，
颜常武以东南府初创，岂可学明朝内阁、清流（明朝的各部给事中有封驳权）进行掣肘，且东南府创立是新鲜事务，遇到事务可以来“摸着石头过河”，又或者是“交学费”，反正颜大少还年轻，耗得起。
下设人事部（吏部）、战争部（兵部）、财政部（户部）、文教部（礼部）、政法部（公检法）和建设部（工部）共六个部，主官称为部长，还有一些独立的部门，如第一要紧的参谋部，有出兵权；还有首席技术官，是荷人巴伦支出任。
由于官员严重匮乏，人事部是陈衷纪管着，战争部是颜常武自管，财政部是陈和彬、文教部则是徐柏森和张小石合作（两人都是海澄人，颜大少的同乡，秀才出身，做过简体字事务），政
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